１９９９年１２月，明马丹增任西藏噶尔县检察院检察长，２００７年３月至今任西藏自治区检察院公诉三处副处长。

在担任噶尔县检察院检察长期间，明马丹增严于律己，先后制定了《党组学习工作制度》、《班子成员十要十不准》，要求班子成员每人每年完成“４３２２１”任务，即亲自讯问４名犯罪嫌疑人或制作４份讯问笔录；亲自办理或参与办理３起案件；亲自完成上级交办的２个任务；亲自解决群众反映的２个问题；读１本好书。

２００２年至今，噶尔县检察院共受理提请批捕案件１０１件１６３人，其中经审查批捕７６件１２９人，不捕２５件３４人；经审查起诉５３件９０人，不起诉１５件２４人，全部在法定时限内办结。起诉的案件，法院均作了有罪判决。批捕的准确率和起诉的准确率均达到了１００％。２００５年２月，噶尔县检察院被高检院评为全国先进检察院。

２００４年７月，他被自治区检察院记二等功，２００６年２月，被最高人民检察院授予“全国模范检察官”荣誉称号。