立场坚明 始终追随孙中山并肩战斗
1916年初,袁世凯称帝,伍廷芳坚决反对,踊跃加入了反对南北军阀斗争的行列,与孙中山为首的国民党并肩战斗。
1920年11月,伍廷芳追随孙中山由沪返粤;重组军政府,任总裁兼外交部长。12月,通告反对各国向北洋政府发放贷款。次年1月,伍廷芳又与孙中山通告广州各国领事,声明收回广东海关管理权。1921年4月,孙中山重组中华民国政府,军政府撤销。伍廷芳被任命为外交部长。
1922年6月16日,陈炯明叛变,炮轰总统府,软硬兼施,企图拉拢伍廷芳父子反对孙中山,甚至派叛军到伍家捣乱、限制其自由。在如此危难的时候,逃出火海的伍廷芳于次日冒险亲赴楚豫舰谒见孙中山,表示坚持与孙中山合作,并通告各国驻广州领事馆严守中立。